يساعد مكتب الإشراف الداخلي المدير العام على إدارة موارد المنظمة من خلال عمليات التدقيق والمراجعة، وعمليات التقييم، وعمليات التدقيق في الجودة، وعمليات التفتيش، والتحقيقات، والرصد.
وتتمثل مهمة مكتب الإشراف الداخلي في تعزيز وحماية قيمة المنظمة وتحسين عملياتها من خلال توفير تأكيد موضوعي قائم على المخاطر وتقديم المشورة والرأي النافذ. ويساعد المكتب المنظمة على تحقيق أهدافها من خلال تطبيق نهج منظم لتقييم عمليات إدارة المخاطر والرقابة الداخلية والحوكمة وتعزيز كفاءتها وفعاليتها ، وذلك لإضافة قيمة من خلال تحسين الكفاءة الاقتصادية وكفاءة العمليات وفعاليتها.
ويُزوِّد المكتبُ الدولَ الأطراف والمدير بتأكيد معقول بأن ضوابط الرقابة المتعلقة بالمسائل المالية والتشغيلية والسرية والأمن كافية ويُمتثل لها، وأن إدارة الموارد والبرامج تتسم بالكفاءة والفعالية. ويتّبع المكتب في أعماله المتعلقة بالمراجعة والتدقيق (عمليات المراجعة الداخلية والتدقيق في السرية) المعايير الدولية للممارسة المهنية المعمول بها في مجال المراجعة الداخلية للحسابات (الصادرة عن معهد المراجعين الداخليين في الولايات المتحدة الأمريكية).
وتُعَدّ وظيفة التقييم في منظمة حظر الأسلحة الكيميائية جزءاً من آلية الرقابة الداخلية للمنظمة ويديرها مكتب الإشراف الداخلي. وتتمثل مهمتنا في تعزيز المساءلة والمسؤولية من خلال إجراء عمليات تقييم مستقلة وموثوقة وذات نفع لبرامج المنظمة وأنشطتها. ويتَّبع المكتب معايير التقييم التي وضعها فريق الأمم المتحدة المعني بالتقييم.
ويجري مكتب الإشراف الداخلي أيضًا مراجعة للسياسة والاستراتيجية المتعلقتين بضمان الجودة ابتغاء الحفاظ على برنامج شامل يهدف إلى تلبية متطلبات المعايير الدولية التالية الخاضعة لتقييم مجلس الاعتماد الهولندي (RvA): المعيار 2005:17025 (المتطلبات العامة لكفاءة المختبرات المعنية بالاختبار والمعايرة)؛ والمعيار 2010:17034 من معايير المنظمة الدولية للتوحيد القياسي (ISO)/اللجنة الكهرُتقنية الدولية (IEC) (تقييم الامتثال – المتطلبات العامة لاختبار الكفاءة).
ولمّا كان مكتب الإشراف الداخلي قد أنيط به الإشراف على نظام إدارة الجودة في الأجزاء المعتمدة من الأمانة الفنية ، فإن المكتب مسؤولٌ عن إنشاء نظام ضمان الجودة الخاص به وبمختبر المنظمة وبإجراءات التحليل في الموقع والحفاظ على اعتماده. وعلى الرغم من أن التركيز ينصبُّ على مختبر المنظمة ، إلاَّ أن مكتب الإشراف الداخلي مسؤول عن إدارة عمليتين معتمدتين: قاعدة بيانات التحاليل المركزية الخاصة بالمنظمة وقواعد البيانات الموقعية، والتصديق على عملية تحضير معدات التحليل بالفصل الكروماتوغرافي الغازي المقترن بالقياس الطيفي الكتلي المستعان بها أثناء التفتيش، واختبارها.
بالإضافة إلى ذلك، يجري مكتب الإشراف الداخلي عمليات تدقيق في الرقابة تشمل ضمان الجودة، وفقاً لمعايير التدقيق الحالية للمنظمة الدولية للتوحيد القياسي، وتقييم “الشبكة المعنية بالتحاليل، بما في ذلك تقييم برنامج المنظمة لضمان/مراقبة الجودة فيما يخص التحاليل المجراة في عين المكان وتقييم مختبر المنظمة، بالإضافة إلى تقييم أداء المختبرات المعيّنة وسائر المختبرات.
بالإضافة إلى ذلك، من خلال إدراج مسؤوليات مدير الجودة (حالياً SEQAO) ضمن وظيفة الرقابة، فإن مكتب الإشراف الداخلي هو المسؤول عن مجموعة العمليات المتعلقة بالإدارة اليومية لنظام إدارة الجودة.
ويؤدي المكتب مهامه باستقلالية تحت سلطة المدير العام.